1. Административно-управленческий персонал 
- директор 
- заместитель директора 
- главный бухгалтер 
- экономист 

2. Отдел программного обеспечения 

3. Отдел медицинской статистики 

4. Отдел сетевых технологий и защиты информации 

5. Отдел мониторинга и прогнозирования 

6. Отдел сопровождения регионального сегмента единой государственной информационной системы в сфере здравоохранения 

7. Отдел развития информационных технологий 

8. Административно-хозяйственный отдел 

9. Отдел сводной отчетности и финансового контроля 

10. Отдел по работе с обращениями граждан 

11. Хозрасчетный отдел